31 Mart 1977 tarihinde İzmir İl Emniyet Müdürlüğünde göreve başlayan Bardakçı, sırasıyla Diyarbakır, Muğla, Afyon polis okulu, Balıkesir Polis okulu ve APK Daire Başkanlığında çalıştıktan sonra 7 Şubat 2002 yılında emekli olmuştu. Evli ve iki çocuk babası olan Bardakçı, yakalandığı kanser hastalığından dolayı tedavi görmekte olduğu Karaman Devlet Hastanesinde hayatını kaybetti. 67 yaşındaki Mustafa Bardakçı, Mersin’in Mut İlçesi'ndeki camide düzenlenen resmi cenaze töreninin ardından Kale Mahallesi Eski Şehir Mezarlığı’nda gözyaşları arasında toprağa verildi.<br /> <br /> Törene Kaymakam Mehmet Ali Akyüz, Emniyet Müdürü Murat Güney, daire amirleri, yakınları ve çok sayıda vatandaş katıldı.